تنوع ژنتیکی و فشار انتخاب وارد بر ژن پروتئین حرکتی ویروس برگ بادبزنی مو در جدایه های ایرانی

نویسندگان

  • محمود کریمی دانشجوی کارشناسی ارشد بیماری‌شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه آزاد اسلامی- واحد دامغان
چکیده مقاله:

پروتئین حرکتی در ویروس­های گیاهی نقش­های متعددی بویژه حرکت از یک سلول-به-سلول را برای ایجاد آلودگی سیستمیک بر عهده دارد. پروتئین حرکتی در ویروس برگ بادبزنی مو (Grapevine fanleaf virus, GFLV) با ایجاد ساختارهای لوله­ای شکل در پلاسمادسماتاها مسئول انتقال سلول-به-سلول ویروس در گیاهان میزبان است. در پژوهش حاضر تنوع ژنتیکی ژن پروتئین حرکتی GFLV در جدایه­های ایرانی جمع­آوری شده از تاکستان­های استان­های مرکزی، آذربایجان­شرقی، آذربایجان­غربی، زنجان، اردبیل و قزوین بررسی شد. بعلاوه فشار انتخاب وارد شده بر آنها تخمین زده شد. به این منظور تعداد 246 نمونه به صورت تصادفی جمع آوری شدند که از میان آنها 33 نمونه توسط آزمون DAS-ELISAآلوده به GFLV تشخیص داده شدند. ژن پروتئین حرکتی طی آزمون آرتی-پی­سی­آر تکثیر و سپس تعیین توالی شد. نتایج آنالیزهای فیلوژنی نشان داد که حداقل دو دودمان ازجدایه­های ویروس برگ بادبزنی مو براساس توالی پروتئین حرکتی در ایران وجود دارند. داده­های حاصل از تعیین توالی این ژن نشان داد که اندازه ژن پروتئین حرکتی در تمامی جدایه­های بررسی شده این ویروس ثابت و 1044 نوکلئوتید است که حاکی از عدم تحمل این ژن به رخدادهای حذف یا اضافه می­باشد. پارامترهای ژنتیک جمعیت نشان داد که ژن پروتئین حرکتی در جدایه­های ایرانی و سایر جدایه­های این ویروس تحت فشار انتخاب منفی شدیدی قرار دارد، اما میزان این فشار بطور یکنواخت بر روی این ژن توزیع نشده است.  

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

بیان ژن پروتئین حرکتی جدایه ایرانی ویروس برگ بادبزنی مو در باکتری escherichia coli

چکیده ویروس برگ بادبزنی مو grapevine fan leaf virus (gflv) از خانواده comoviridae، یکی از مخرب ترین بیماری های مو در سراسر جهان می باشد. پیکره این ویروس دوذره ای، جورقطر و به قطر 30 نانومتر بوده و در طبیعت توسط نماتد xiphinema index منتقل می شود. این بیماری باعث زوال پیش رونده مو می گردد به طوریکه منجر به کاهش راندمان محصول تا بیش از 80% می شود. با توجه به محدودیت روشهای کنترل رایج این بیماری ...

15 صفحه اول

بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های ویروس برگ بادبزنی مو (grapevine fanleaf virus) در استان های فارس و کهگیلویه و بویراحمد

ویروس برگ بادبزنی مو (grapevine fanleaf virus, gflv) متعلق به جنس nepovirus از خانوادهsecoviridae  است. این ویروس عامل یکی از مخرب‏‏ترین بیماری های ویروسی مو در سراسر دنیا است. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی gflv در تاکستان‏‏های استان فارس و کهگیلویه و بویر احمد از درختان مو و علفهای هرز موجود در تاکستان ها نمونه برداری شد. با استفاده از آنتی‏‏بادی جدایه ایرانی ویروس، در آزمون الیزا  علاوه بر تاک د...

متن کامل

شناسائی و تعیین تنوع ژنتیکی ژن پروتئین پوششی ویروس برگ بادبزنی (grapevin fanleaf virus) مو در استان خراسان رضوی

ویروس برگ بادبزنی مو (grapevine fanleaf virus, gflv) متعلق به جنس nepovirus از خانواده secoviridae است. این ویروس یکی از مخرب¬ترین بیماری ویروسی مو در سراسر دنیا است که موجب خسارت جبران ناپذیری در تاکستان¬ها می شود. به منظور شناسایی و بررسی تنوع ژنتیکی gflv در تاکستان¬های استان خراسان¬رضوی در طی سال¬های 1391 و 1392 از تاکستان¬ها و علف هرز های موجود نمونه برداری شد. با استفاده از آنتی¬بادی جدایه...

کاربرد ایمنوگلوبولین G خالص شده پروتئین‌های پوششی و حرکتی ویروس برگ بادبزنی مو توسط ستون DEAE سلولزی برای شناسایی ویروس برگ بادبزنی مو

در تحقیق حاضر از جدایه‌های بومی ویروس برگ بادبزنی مو (Grapevine fan leaf virus (GFLV) برای تهیه آنتی‌بادی نوترکیب استفاده شد، بدین ترتیب ژن‌های پروتئین پوششی و حرکتی ویروس تکثیر و در پلاسمید pET21a همسانه‌سازی و به باکتری (Escherichia coli (BL21) منتقل شدند. پس از بیان ژن‌های مذکور پروتئین‌های بیان شده تخلیص و برای ایمنی زایی خرگوش استفاده شدند. پس از ایمنی‌زایی توسط پروتیئن-های پوششی و حرکتی، ...

متن کامل

روش ارزیابی فعالیت مهارکننده های خاموشی ژن در گیاه با استفاده از دو پروتئین از ویروس برگ بادبزنی مو (GFLV)

مهارکننده­ های RNA Silencing در گیاهان، جانوران و بیشتر ویروس­های بیماری­زای گیاهی به خوبی توصیف شده­اند و نیز شیوه شناسایی فعالیت مهارکنندگی خاموشی ژن یک پروتئین در سیستم گیاهی راه اندازی شده است. ویروس برگ بادبزنی مو (GFLV) Grapevine fanleaf virus  یکی از شایع­ترین ویروس­های شناخته شده مو در سراسر دنیا است که تا 80 درصد خسارت می­زند. این ویروس دوپیکره­ای با ژنوم RNA تک رشته­ای در جنس Nepoviru...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


عنوان ژورنال

دوره 38  شماره 1

صفحات  37- 49

تاریخ انتشار 2015-03-21

با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.

کلمات کلیدی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023